עם התקדמות הלחימה, נחשפת גם מערכת המנהרות המשוכללת שבנה חמאס במשך שנים. מתחת למחנה הפליטים, שכיבושו הושלם , נמצאו מנהרות בעומק 20 מטר, מצויידות במערכות חשמל ומיזוג ומעלית מהקרקע שמורידה את הלוחמים פנימה.
חמאס התאמץ להסתיר מנהרה אסטרטגית שלו שנבנתה בעומק 20 מטרים מתחת לאדמה. אלא שכוחות ההנדסה איתרו את הפתח שהיה חסום בבטון, חרצו אותו, וחשפו את גודלה העצום. אותה מנהרה היתה מצוידת גם במעלית, שהורידה את לוחמי החמאס פנימה, ובתוך המנהרה נמצאו מערכות מיזוג אוויר וחשמל.
בצה"ל טוענים כי צמרת חמאס בהם יחיא סינוואר, מרואן עיסא ומוחמד דף שהו לצד מח"טים ומג"דים במרובע הביטחוני בתת קרקע, אולם על פי סימנים שנמצאו במקום, הם נמלטו משם כשהבינו שכוחות צה"ל מתקרבים.


















